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果子RNAseq,ChIPseq,ATACseq科研多组学分析课程NGS00招生啦

果子学生信  · 教育 生物  · 11 小时前

这是果子学生信团队最新发布的NGS生物信息上游分析课程。代号NGS00,这是第二期。

授课内容概况

课程预计8天以上(分批授课)

  • Linux 从头开始学 2天
  • 转录组上游分析从头开始学2天
  • ATACseq数据分析1-2天
  • ChIPseq数据分析1天
  • Nature Genetics文献复现(预期2天+)

彩蛋: 服务器管理和SnakeMake 批处理, 展示多样本大项目的处理与管理经验(搭建数据库会用得到)

第二期增加的内容

1. 会将第一期的内容梳理迭代一次,产生一个新的版本,让理解更加充分,让分析更加流程,让能力更加升华,让信心突破天际。

2. 更重要的是,我们会增加一篇Nature Genetics的项目实战,使学员把技能融会贯通,强化大项目的实战经验。这篇Nature Genetics的内容,我个人十分喜欢,我认为他把RNAseq,ATACseq,ChIPseq有机的整合在了一起,十分值得学习。

这里面还展示了一个技能,就是从ATACseq中使用岭回归得到转录因子,这个要是跟RNAseq的转录因子GSEA结合一下,会锦上添花。

他综合了RNAseq的结果,充分利用ATACseq,以及自测ChIPseq,公共ChIPseq数据,是多组学涨经验不可多得的模板。到了这里我们可以这样理解,如果RNAseq 的富集分析靠既往的经典基因集,ATACseq的分析应该充分利用既往的公共ChIPseq数据。

把这一套分析学会,再尝试一下自己建库把价格压到最低,那么一条10+文章的自救路线就诞生了!

生信学习方式的改变

洲更为了这个课程,写了一本书(内容十分多) 里面的主干内容是这样的

点开后里面就是这种文字代码混合的手把手笔记教程除了主干内容之外,还有分支,内容确实详细

重点来了!他写这本书的使用的是wolai,他把这个笔记开放给了所有学员,意味着大家有了一个十分有用的能够检索的上游分析知识库。

我们需要的常用的并且经过检验的代码、资源都可以轻松的检索出来。

课程参与人员要求:

1. 你对Linux,服务器,多组学,表观遗传分析有需求,并且有时间精力学习完这个大课程

2. 你需要有R语言基础,这是基本要求,因为这些组学的下游分析以及综合分析,需要用到R语言。

课程报名信息

课程费用是:3200RMB/人,童叟无欺。

课程在腾讯会议线上开展, 首次直播时间在2024年11月16到11月17日,后续直播会在答疑群内通知。

钟意的朋友扫码在微店直接下单(代号NGS00 ),下单后联系果子,可以提前学习起来。

课程提供邀请函,支持开发票(培训或者会议,不支持试剂)

当前报名优惠:

1. 报名后拉群,会获得第一期的完整课程,可以先学习起来。

2. 给学员配套课程运行服务器到2025年5月30日

3. 在开课前享受拼团减300的优惠。

第一期学员福利:

1. 第一期学员(属于内测学员),在原答疑群免费接受更新,会同步课程的直播和录播,但是不提供练习服务器(多理解)

2. 如果第一期学员需要练习服务器以及从心理上去掉自己老学员的枷锁,轻松上阵(当成新学员加入新答疑群),微信私信果子,补交1000即可。

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