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要问我,这南京医科大学博士生的10.7分SCI文章咋样!虽然讲的这巨噬细胞代谢重编程,故事不错,内容还是不连贯……

实验万事屋  · 科研  · 11 小时前

正文

巨噬细胞的极化一直以来都是大家比较关注的,特别是在巨噬细胞极化后产生了细胞间的Crosstalk,一听就是个好故事。今天讲的这篇文章,就是糖尿病环境中巨噬细胞的极化变化,以及巨噬细胞及内皮细胞之间的互作。这篇文章是南京医科大学附属眼科医院的博士生,发表在10.7分的Redox Biology上的文章。怎么说呢,虽然这篇文章做的内容是挺多的(有一些验证环节上,特别是在后期GPX2的验证上,还是有一点亮点的,由于那部分的验证推理的步骤做得还是不错的,并没有犯太大的逻辑错误,不清楚科研推理过程的话,可以去看看《科研的推理和逻辑:从实验台到咖啡桌》和《列文虎克读文献》 ),但可惜的是,这篇文章没有能将巨噬细胞极化以及对内皮细胞的互作结合起来,总的来说缺少一些衔接,我们就一起来看看他们都做了什么吧:

他们研究的是一个circRNA——cSPECC1,这个circ在高糖刺激下,会在巨噬细胞中表达增高。同时这个cSPECC1是随着高糖诱导作用的时间增加,在巨噬细胞中表达升高的(这其实就是归纳法中米勒五法的共变法分析,通过高糖刺激对于cSPECC1表达的影响的时间相关性,建立了两者的联系,不清楚归纳法或者米勒五法的话,可以去看看《科研的推理和逻辑:从实验台到咖啡桌》、《列文虎克读文献》和《信号通路是什么鬼?》系列)。他们在确认了高糖会诱导cSPECC1表达后,接着,就分析了对于巨噬细胞的具体影响。在这里他们分析的是巨噬细胞的极化变化,结果发现高糖刺激后,巨噬细胞的M1极化明显增强,而在cSPECC1敲减后,M1极化则被抑制了:

接下去,他们就放下了cSPECC1对于巨噬细胞极化的影响,开始分析巨噬细胞对于内皮细胞互作了。这里他们使用了共培养,分析过表达cSPECC1或敲减cSPECC1的巨噬细胞,对于内皮细胞会造成什么样的影响和变化(这一步其实是柯霍氏法则的验证,通过分析巨噬细胞内cSPECC1的表达与否,来验证cSPECC1对于巨噬细胞和内皮细胞之间通讯的表型,不清楚柯霍氏法则的话,可以去看看《轻松的文献导读》和《科研的推理和逻辑:从实验台到咖啡桌》)。结果发现cSPECC1在巨噬细胞中的表达变化,会影响共培养的内皮细胞的增殖以及迁移表型,并影响内皮细胞的管腔形成能力,这其实就是血管新生所必须的内皮细胞功能。而糖尿病小鼠的体内模型也显示,cSPECC1能在体内影响巨噬细胞的极化,并在高糖诱导糖尿病后,促进cSPECC1高表达的巨噬细胞招募到视网膜上:

于是他们提出了一个这样的假设,假设cSPECC1高表达的巨噬细胞,会通过M1极化造成炎症,并通过促进血管的生成,在高糖环境或糖尿病人体内,造成糖尿病眼病(假设的迭代,就是基于已有信息,并总结出来的,通过对之前研究结果的总结,首先高糖促进cSPECC1表达会导致巨噬细胞M1极化,另一方面视网膜上浸润的巨噬细胞,又能影响内皮细胞变化,而糖尿病损伤后,白细胞浸润是视网膜血管炎症的标志,假设的迭代,就在这一次次的推理中,推进了课题的进展,不清楚假设迭代的话,可以去看看《科研的推理和逻辑:从实验台到咖啡桌》和《信号通路是什么鬼?》系列)。他们通过对糖尿病小鼠的cSPECC1敲除或过表达,发现在糖尿病小鼠模型的体内,cSPECC1的表达的确能调节视网膜血管炎症和血管完整性。接着,他们又对糖尿病小鼠的巨噬细胞进行了Cre-LoxP系统的特异性敲除,结果也是一样的:

那么cSPECC1调控的具体机制是什么呢?他们对敲减cSPECC1后的巨噬细胞进行二代测序,结果发现花生四烯酸信号通路、Ras信号通路、MAPK信号通路和PI3K-AKT信号通路都受到了影响。其中花生四烯酸通路最明显,于是他们分析了俩关键蛋白,一个是GPX2,另一个是PLAAT3,但PLAAT3的基础表达较低,所以排除了。然而GPX2并不能与cSPECC1结合,于是他们就先进行了代谢组学分析,结果发现羟基脂肪酸12-HETE明显增多。通过敲减了巨噬细胞的cSPECC1后,加入12-HETE,分析对共培养内皮细胞的影响,他们确定了巨噬细胞中cSPECC1→12-HETE对于内皮细胞的作用。那么GPX2作为cSPECC1→12-HETE中间的一环,应该如何验证机制呢?他们通过RIP发现cSPECC1能结合eIF4A3,并在细胞中共定位,eIF4A3是一个翻译相关的蛋白。而GPX2的mRNA又能结合eIF4A3,敲减了cSPECC1后会影响eIF4A3与GPX2的mRNA之间的结合,降低了GPX2的mRNA稳定性,导致了GPX2表达的下降(这部分的机制验证,可以说是这篇文章比较亮眼的地方了,通过一步步的推理和假设的迭代,得到结果并否定原有的假设,在原有假设上提出新的假设,是最困难的,将原本不能与cSPECC1结合的GPX2,容纳到了整个通路中,在机制上也显得更为完整了,不清楚假设或假设迭代的话,可以去看看《科研的推理和逻辑:从实验台到咖啡桌》、《列文虎克读文献》和《信号通路是什么鬼?》系列):

最后就形成了这样的示意图(这个是我随便画的,具体的画法其实在《夏老师带你读文献》里也教过大家了,有兴趣的话可以自己去翻翻),在高糖环境下,巨噬细胞中cSPECC1表达增强,促进了巨噬细胞的M1极化。而cSPECC1通过招募eIF4A3并结合到GPX2的mRNA上,促进了GPX2表达,通过花生四烯酸通路产生了大量的12-HETE。这些12-HETE会激活内皮细胞增殖、迁移以及血管新生:

这篇文章的优缺点都挺明显,优点是在最后的机制研究中,能明确HG→cSPECC1→eIF4A3→GPX2→12-HETE→内皮细胞互作。缺点是在巨噬细胞M1极化的研究中,其实还是没有确定机制,也就是说无法将巨噬细胞的M1极化和巨噬细胞与内皮细胞互作,通过cSPECC1有机地结合起来。如果能够做到有机地结合,这篇文章应该会更有意思。好了,今天就先策到这里吧,有兴趣的话可以看看原文,祝你们心明眼亮。

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